明泰E90采用的是明泰自主研发的My OS操作系统，该系统拥有占CPU内存小、运行处理速度快、智能省电等优势，可自由下载及安装各种最新应用程序，且操作简单明了，具有多任务处理的能力、多屏切换、文件夹合并、云存储等多种功能。
在文章开篇的时候，小编曾介绍过明泰E90具有iPhone系统一样漂亮的UI界面，而且外观方面也能找到很多iPhone的影子。因此，明泰E90的解锁界面和iPhone也是如出一辙。当然，明泰E90还内置了其他5种解锁风格，用户可以根据自己需求在“屏锁风格”中进行设置。
和iPhone一样的是，明泰E90没有菜单，所有程序都被置于桌面界面上。主界面可以左右滑动，左边第一屏是百度搜索工具栏，从第二屏开始就都是应用程序的图标了。每一分屏界面下方都始终显示音乐、电话、通讯录和信息四个程序。
在显示应用程序的界面上长按某一图标，后期安装的部分程序图标就会发生变化。此时可以任意移动或者改变应用程序的位置。如果是后期安装上去的程序，图标上还会附带一个小叉子，点击这些带有小叉子的图标就可以删除相应的应用程序，同样汲取了iPhone系统的精华。
这里必须要说的是，明泰E90还同样汲取了Android系统的精华，在屏幕顶部下拉，可以出现如同Android手机一样的通知菜单。在此可以管理蓝牙、手机模式和环境光感，也可以查看所有未读的通知消息。
