koobee S306运行Android智能操作系统，并且对用户界面进行了一定的二次开发，主界面下边缘处固定了通话、电话薄、短信、应用程序菜单四个功能键，应用程序界面为横向切换滑动，每一屏可以容纳16个应用图标，但下边缘的功能键没有变化。
众所周知，koobee手机品牌形象代言人是亚洲性感天后蔡依林，因此koobee S306内置了多套蔡依林的高清壁纸。并且S306还支持视频壁纸功能，打开手机随时随地可以看到自己的偶像，这也一种用户体验。
koobee S306同样内置了koobee自主研发的多项应用，如蝌蚪市场（下载管理应用程序），蝌蚪天气（天气预报），蝌蚪便签（便捷记事本），蝌蚪卫士（阻截短信、电话骚扰）。其他包括金山WPS文档处理、数据备份恢复、通话录音、号码归属地显示、电话本同步备份，全都是koobee S306应用层面的优势。
