华为G9Plus采用3D指纹识别技术，3D识别速度相比上一代提升一倍，准确率提升15%。普通2D的指纹信息采集平面信息，华为G9Plus可以采集Level 4的3D指纹信息，包含手指指纹的高度信息，就是在指纹脊线与谷线之间的高度信息，进一步提高指纹识别的安全性。
华为G9Plus可以做到360度解锁，也就是说在各个角度下0度：99.5%；45度：99.3%；90度：99.5%，都能达到优秀指纹识别水平，整体的正常手指主观解锁率方面变现出色。
指纹识别加入更多玩法
指纹安全对于手机用户来说变得越来越重要，因为2D的指纹信息采集平面信息很容易被复制，从而造成财产和隐私的安全性降低；华为G9Plus加入安全算法，level1全局特征，level2局部脊线特征，level3脊线细节特征，level4 3d 指纹采集(防伪，立体的指纹信息)，这将有效保护手机安全。
华为G9Plus在指纹识别按键上加入了更多的玩法，如：上下滑动指纹可下拉或隐藏手机通知、左右翻图片、支持长按拍照、长按接听电话、长按关闭闹钟等功能设置。
支持支付宝、华为Pay、京东钱包指纹支付
华为G9Plus的指纹识别支持自学习功能，首次录入指纹后，在用户使用的过程中，自动检测更加指纹，提升指纹识别的成功率；此外，支持熄屏下按特定手指直接进入支付宝支付界面；在国内，支持支付宝、华为Pay、京东钱包指纹支付。
